El Consejo de Justicia, es una entidad con más de 50 años de existencia, reorganizado, en la actualidad por el Concejo de Bogotá (Art. 189 y ss., Acuerdo 079 de 2003), como la máxima autoridad de justicia policiva en la ciudad; razón por la cual no tiene superior funcional y es autónomo en sus decisiones, pero como ente administrativo, estrechamente vinculado en su estructura a la Administración Distrital y por reglamentación del Alcalde Mayor, a la Secretaría Distrital de Gobierno. Así mismo, es superior funcional en los procesos policivos de las 20 alcaldías locales, inspecciones de policía y comandos y subcomandos de estación y de los CAI.

A partir de 1926, cuando a través de la Ley 72 de ese año, se creó la Secretaría Distrital de Gobierno, el Consejo de Justicia depende de ese Despacho y se articula con sus planes estratégicos.

Desde el primer Código de Policía de Bogotá –Acuerdo 36 de 1962-, se crea como tal el Consejo de Justicia con funciones propias. A través de los años, esta institución fue adaptándose a las necesidades de la ciudad, hasta convertirse en el organismo distrital encargado de unificar los criterios en asuntos de justicia policiva como lo señala el actual Plan de Desarrollo “Bogotá Mejor para Todos” en su artículo 115.

El Acuerdo Distrital 637 de 2016 modificó parcialmente el Acuerdo Distrital 257 de 2006, creó el Sector Administrativo de Seguridad, Convivencia y Justicia, la Secretaría Distrital de Seguridad, Convivencia y Justicia, modificó el Sector Administrativo de Gobierno y el objeto y funciones de la Secretaría Distrital de Gobierno.

En desarrollo de lo anterior, el Alcalde Mayor expide el Decreto 411 de septiembre 30 de 2016 “Por medio del cual se modifica la Estructura Organizacional de la Secretaría Distrital de Gobierno" y se derogan los Decretos 539 de 2006, 413 de 2010 y 280 de 2011. A partir de su vigencia, el Consejo de Justicia vuelve y se define como parte de la estructura organizacional de la Secretaría de Gobierno como una dependencia del Despacho del Secretario de Gobierno.

Finalmente, el rediseño institucional se complementó con la Resolución No. 959 del 30 de septiembre de 2016 “Resolución del Manual Específico de Funciones y Competencias Laborales para los empleos de la Planta de Personal de la Secretaría Distrital de Gobierno”, la cual derogó la Resolución 1832 del 9 de diciembre de 2015.